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植物訊息傳遞：玉米水稻澱粉脢基因表現研究。
逆境生理：細胞膜磷脂組成在種子耐旱性所扮演的角色
逆境生理：花粉,種子與植物體耐旱機制之研究
逆境生理：水稻熱休克蛋白質基因群
低溫逆境對植物葉片葉綠體發育的影響
光敏素訊息傳遞研究
植物體中抗線蟲基因研究
甘藷傷害誘導的訊息傳導機制
甘藷胰蛋白脢抑制因子轉殖研究
族群遺傳學研究
臺灣植物親緣地理研究
微生物
臺灣嗜高溫微生物研究
植物菌質體基因體研究
霍亂桿菌毒性相關基因研究
<臺灣茄科計畫> (已結案)
